Στην Καθολική Εκκλησία τιμάται στις 9 Φεβρουαρίου και θεωρείται ως προστάτιδα των οδοντιάτρων. Μέχρι το 1967 την τιμούσαν και στην Ελλάδα οι οδοντίατροι, σαν προστάτιδά τους. Μετά όμως καθιέρωσαν ως προστάτη τους τον Άγιο Αντύπα Επίσκοπο Περγάμου.
Η Αγία Απολλωνία μαρτύρησε στην Αλεξάνδρεια, λίγο πριν ξεσπάσει ο διωγμός επί Δεκίου (248 – 249 μ.Χ.). Περιγράφεται κάπου σαν «παρθένος πρεσβῡτις» που προφανώς σημαίνει ότι η Απολλωνία ήταν Διακόνισσα.
Απολυτίκιο
Των οδόντων εκρίζωσιν καθυπέμεινας και συντριβήν των σων γνάθων, Απολλωνία σεμνή, εκλεκτή παρθενομάρτυς και παρέδωκας σώμα το θείον σου πυρί, ίνα δρόσου θεϊκής παστάδος επαπολαύσης και χάριν λάβης οδόντων διώκειν άλγη τα κατώδυνα.